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国际人类基因组单体型图计划
 

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以往新闻
  • 2005年10月24日:HapMap数据第19次公布
    HapMap项目第一期和第二期的基因分型、频率和实验设计等数据现在可以下载。这批数据将所有第一期和第二期数据混合在一起。

    Populations CEU CHB JPT YRI
    Total QC+ SNPs 3,901,408 3,903,524 3,902,623 3,806,920
    Total Genotyped SNPs 5,894,684 5,812,990 5,812,990 5,857,466

  • 2005年9月28日:HapMap第18次数据公布
    2、6、11、14、15和21号染色体最新的基因分型、频率和实验设计等数据现在可以 下载。请注意这表示CEU和YRI人群中这些染色体的第二期数据已经完全。这批数据将所有第一期和第二期数据混合在一起。本次数据公布的概要如下:

    Populations CEU CHB JPT YRI
    Chr 2 527,434 354,069 354,069 527,707
    Chr 6 385,351 124,729 124,729 386,208
    Chr 11 295,079 52,669 52,669 293,444
    Chr 14 173,577 65,117 65,117 170,624
    Chr 15 149,378 41,399 41,399 147,373
    Chr 21 86,213 37,932 37,932 85,417
    Total 1,617,032 675,915 675,915 1,610,773

  • 2005年9月21日:HapMap指导会议——美国人类遗传学协会(American Society of Human Genetics,ASHG)2005年年会

    Salt Palace Convention Center,Ballroom ABCD,周四,10月27日,下午6点30分至8点30分

    Wellcome Trust和NIH/NHGRI将就有效使用HapMap数据提供2小时的指导,包括HapMap介绍(Dr. Aravinda Chakravarti,Johns Hopkins University),在关联研究中使用HapMap数据、tagSNP的选择和选择SNP使用芯片进行研究(Dr. Mark Daly,Broad Institute),HapMap网页使用指导(Dr. Lincoln Stein,CSHL),其他的演讲者包括Dr. Toshihiro Tanaka(RIKEN),Dr. Michael Boehnke(University of Michigan)和Dr. Augustine Kong(deCODE)等。

    注册人数限制在1000人,注册截至日期为2005年10月14日,会议没有额外的费用,但是参与者首先必须先注册参与ASHG会议

    更多的信息以及注册,请访问,http://www.capconcorp.com/hapmaptutorial.

  • 2005年9月19日:HapMap使用者调查
    请花费片刻时间来参加 HapMap使用者调查,这将帮助我们不断改善,以满足您的需求。

  • 2005年8月17日:首次HapMap第二阶段数据发布
    首批发布的HapMap第二阶段数据现在可进行 批量下载。本次发布的数据来自第二阶段最初在2号染色体短臂上的引导性工作。这批数据对先前发布的第一阶段数据(16c.1)是一个补充,将这些数据文件联合起来就能得到全部数据。这批数据包括对600,180个新的SNP位点的基因分型(共计54,016,200反应)。

  • 2005年6月21日:HapMap数据公布 #16c.1.
    这是最终冻结的第一阶段数据,将用于随后的HapMap文章(详见数据发布前的冻结 )。这次公布的数据中,将把中国北京汉族人样品的简称改作CHB(详见HapMap出版和介绍中关于项目取样群体的指导方针)。基因分型的SNP位点的总结如下:

    Populations CEU CHB JPT YRI
    Genotyped SNPs 1,105,072 1,088,689 1,088,426 1,076,451

  • 2005年2月8日: HapMap新闻 2004年第一卷
    这是Coriell医学研究所出版的系列通讯的第一卷,旨在告知社区成员他们的样本如何被使用。该通讯中的所有文章都将以参与样本捐赠的社区的语言来获取。

  • 2005年2月7日: 国际HapMap协作组扩大制图规模
    在获得额外的三百三十万美元公众-私人资金后,国际HapMap协作组宣布创造一张比原计划更加强大的人类遗传变异图。该图将加速发现与如哮喘、癌症、糖尿病和心脏病等常见疾病相关的基因。

  • 2005年5月27日:即将到来的HapMap数据发布
    随着接近对第一期基因分型数据检查的完成,某些SNP位点被认为是存在问题的,这使得它们的基因分型结果的质量过低或者错误。新版的数据对这些问题进行了修正。这些数据正在准备当中,预计将在下周发布。在这期间,对这些数据的描叙以及有问题的SNP位点的列表将在看到

  • 2005年3月1日:第16次数据公布
    这是本项目第一期工作的数据,是本项目的一个里程碑,包括在所有被研究人群中对共有SNP进行5kb密度的分型。数据可从批量下载图形浏览获得。SNP分型结果的总结如下:

    Populations CEU HCB JPT YRI
    Genotyped SNPs 1,073,663 1,044,686 1,044,416 1,034,205

  • 2005年02月18日: 第15次数据公布
    有关中国汉族人群、日本人群和约鲁巴人群样本的额外信息,请从点击此处获得。基因分型数据可批量下载。已分型SNP的情况可看。

    Populations CEU HCB JPT YRI
    Genotyped SNPs 1,050,307 1,015,490 1,015,226 1,003,169

  • 2004年12月10日:获取HapMap基因分型数据不再需要签署clickwrap协议书。使用者请查看数据使用指导中的相关条款,以确保免费而又无障碍的获得数据。同时可阅读旧的协议书以作参考。

  • 2004年12月10日: HapMap会议:基因组研究和HapMap 英国牛津大学: 2005年3月15日-18日

    到2005年3月,HapMap项目将完成第一阶段(在270个个体中对60万个常见的SNP进行基因分型),并开始第二阶段(在相同的样品中对225万额外的SNP进行基因分型)的工作。但是,在遗传研究中如何更好的利用这些信息,仍然是未解决的问题。此次会议由牛津大学统计系主持,中心议题是在人类疾病研究、群体遗传和进化分析等基因组研究中使用HapMap资源。

    不论是直接参与HapMap项目,或是分析各种数据,或是关注疾病研究,“基因组研究和HapMap”将为这些不同的研究机构提供重要的机会,使它们能够聚在一起,明确并讨论与使用HapMap数据相关的问题。会议还将提供对HapMap项目的进展和结果的最新的评价。HapMap项目以外的特邀报告人有Andy Clarke,David Clayton,Mark McCarthy,Jonathan Pritchard,Matthew Stephens和Simon Tavaré。2004年春季成功的召开了一次会议,100多位与会者对与HapMap项目相关的方法学和数据分析感兴趣,此次会议有望延续上次会议的成功。

    我们邀请您参与并注册此次会议,并希望您能为海报或简介提交摘要。
    摘要提交的截止日期为2005年1月28日。
    注册/房间预订的截止日期为2005年2月25日。
    有关提交摘要、注册会议的细节指导,以及此次会议的细节内容,请参考本次会议的网站 http:/www.hapmap.org/oxford_conference/default.html

  • 2004年12月10日: 第14次数据公布
    有关中国汉族人群、日本人群和约鲁巴人群样本的额外信息,请从点击此处获得。基因分型数据可批量下载。已分型SNP的情况可看。

    Populations CEU HCB JPT YRI
    Genotyped SNPs 956,730 412,669 412,608 432,523

  • 2004年11月23日:第13次HapMap公共数据发布,现在可以获得所有三个HapMap取样人群的数据。
    有关中国汉族人群、日本人群和约鲁巴人群样本的额外信息,请从点击此处获得。基因分型数据可批量下载。已分型SNP的情况可看。

    Populations CEU HCB JPT YRI
    Genotyped SNPs 856,726 386,323 386,274 406,783

  • 2004年10月12日:新通用基因组浏览器的特点
    当使用浏览器时,可对连锁不平衡(LD),杂合度和SNP覆盖度等信息进行追踪。能使用三种方法来进行LD分析:LOD值(LOD score),D''和 R Square。LD数据可通过下载获得。能够打开或关闭对浏览区域的总览(Overview)。SNP分型结果上以不同字体显现等位基因频率信息。

  • 2004年10月12日:获取HapMap计划所用的实验方案。包括HapMap计划中的实验设计、分型结果、数据递交程序和质量评价/质量控制等内容。

  • 2004年10月12日: 第12次数据公布
    共发布752,208个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有67,698,720个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年8月26日:发布与HapMap计划相关的新信息。
    现在可获得什么是HapMap单体型的起源对人类的益处取样群体伦理学问题数据发布政策等方面对的内容。

  • 2004年09月02日: 第11次数据公布
    共发布693,255个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有62,393,760个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年9月28日:网络维护计划
    定于美国东部时间(EST)10月2日下午10点至次日凌晨6点,对位于冷泉港实验室的网络系统进行维护,届时HapMap主页及其他相关网页将暂时关闭,我们对此表示歉意。

  • 2004年08月16日: 第10次数据公布
    共发布661,094个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有59,498,460个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年07月20日: 第9次数据公布
    共发布639,110个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有57,519,900个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年06月15日: 第8次数据公布
    共发布614,030个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有55,262,700个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年5月27日: “国际HapMap项目中科学与伦理的结合”一文将于2004年6月在 Nature Reviews Genetics上发表

  • 2004年5月26日:日本镜像网站
    关于HapMap网页的日本镜像已建立,可通过点击http://jst.go.jp来访问。该镜像由日本科学技术振兴机构下属的一个小组负责维护(JST),该网站的建立将加快亚洲和环太平洋区的用户对HapMap网页的访问。
  • 2004年05月04日: 第7次数据公布
    共发布557,083个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有50,137,470个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年04月09日: 第6次数据公布
    共发布462,670个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有41,640,300个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年4月18-20日: 国际单体型图协作组分析会议
    本次会议将讨论与国际人类基因组单体型图计划有关的数据分析和方法问题,包括描述连锁不平衡的方法,连锁不平衡的性质,单体型的推断和频率,单体型图在关联分析和其他疾病研究中的应用。本次会议将为广大研究者(包括直接参与该计划的组织和其他组织)提供一个重要的机会,使大家聚集起来讨论与单体型图资源的创立有关的一系列问题。 本次会议预定于4月18日召开,当日下午六时,将有一个报告和招待会。会议将于4月20日下午3时之前结束。会议主办方为霍普金斯大学的McKusick-Nathans医学遗传学研究所和国立人类基因组研究所。更详细的信息,请访问 国际单体型图协作组分析会议 。 希望分析现有数据的研究者可以使用已冻结的单体型图计划的数据和来自ENCODE项目( www.hapmap.org/genotypes/ENCODE/ )的更为密集的数据。
  • 2004年03月05日: 第5次数据公布
    共发布369,784个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有33,280,560个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年02月06日: 第4次数据公布
    共发布324,613个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有29,215,170个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2004年02月03日: 如要列入HapMap公共邮件列表,请向announcements-request@listhost.hapmap.org发出要求,或填写List页上的表格申请开通。
  • 2004年01月07日: 第3次数据公布
    共发布274,571个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据(其中共有24, 000,000个基因分型数据),可通过下载图形浏览获得这些数据。

  • 2003年12月18日:“国际人类基因组单体型图计划”的文章在《自然》杂志 上发表(见PubMed)。
  • 2003年12月16日:第二次公共数据发布!
    共发布218,497个SNP位点的基因分型、基因型频率和实验数据。可通过下载和图形浏览获得这些数据。请注意文件格式的修改,具体细节请参考” README's”文件(新的基因型格式请使用HaploView v2.03)。
  • 2003 年12 月1日, 已递交超过23万7千SNP位点数据,将于12月上旬发布
  • 2003年11月1日, 发布 第一次公共数据!
    公布了可供公众下载的145,554 SNP 位点的超过一千三百万的分型数据,以及相关基因型频率和实验数据。请在 数据(Data) 区进行下载,也可在 图形浏览(GBrowse) 区进行染色体区域的图形浏览。
  • 2003年10月1日, 已递交137,964个SNP位点的超过一千二百万的分型数据。
  • 2003年9月1日, 已递交超过一千一百万的基因分型数据。
  • 2003年8月1日, 已递交117,000 个SNP位点的超过一千万的基因分型数据。
  • 2003年7月,质量控制SNPs
    递交1500个SNP位点数据,供质量控制分析。
  • 2003年7月1日:数据提交进展
    770万个基因分型数据及超过7.7万个实验设计已递交,供人类基因组单体型图计划分析所用。
  • 2003年6月25日:等位位点频率的数据递交至dbSNP数据库
  • 2003年6月1日:数据提交进展
    超过600万个基因分型数据和6.5万个实验设计已递交。
  • 2003年5月27-28日:国际人类基因组单体型图计划冷泉港会议
    来自各参与中心的代表参加了在冷泉港实验室举行了为期两天的会议
  • 2003年5月1日:数据提交进展
    380万个基因分型数据和4万个实验设计已递交。
  • 2003年3月21日:国际人类基因组单体型图计划网站建成
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  • Last updated : old_news.html.zh,v 1.27 2005/11/02 00:01:02 krishnan Exp

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